John F.Kennedy havalimanında 8 ayrı terminal bulunmaktadır ve bu terminaller arasında işleyen bir tramvay sistemi mevcuttur. (Air Train) Air Train ile terminaller arası seyahat ücretsizdir. Ancak siz Air Train ile Jamaica Station'a gideceğiniz için (Metro ağına bağlanan nokta) 5 dolar ödemeniz gerekecek.(Daha pahalanmış olabilir.) Jamaica Station'a vardığınızda Metro E'yi kullanarak, Penn Station'a (34.street üzerinde bulunan) gidebilirsiniz.